(038290) 마크로젠 - (3)

 

 

(038290) 마크로젠 - (3)

Epigenome, Exome, Fragment 분석서비스 (Genescan서비스), Metagenome, NGS(Next Generation Sequencing), Transcriptome, Whole Genome, 마크로젠, 집단 유전체학 (Population Sequencing), 차세대 염기서열 분석법

 

 

NGS

NGS 사업부

차세대 염기서열 분석법이라 불리는 NGS(Next Generation Sequencing) 기술은 모든 유전자의 집합체인 유전체를 무수히 많은 조각으로 나눠서 읽은 후, 얻어진 염기서열 조각을 조립하여 전체 유전체의 서열을 분석하는 방법입니다. 2000년대부터 해당 기술이 상용화된 이후 관련 기술이 비약적으로 발전함에 따라 단 기간 내에 많은 양의 유전체 정보를 얻게 되었고, 이를 다양한 연구분야에 활용할 수 있게 되었습니다. 특히 유전체 분석 비용과 시간이 점차 감소함에 따라 인간을 비롯한 다양한 생명체의 유전체 분석 수요가 빠르게 증가하고 있습니다. 최근에는 의학 분야를 중심으로 NGS 기반의 임상연구가 활발해지면서 해당 기술을 통한 유전자변이 확인 및 새로운 유전자의 기능을 밝히기 위한 많은 연구가 진행되고 있습니다. 이는 환자 개인의 유전체 정보를 바탕으로 개인별로 최적화된 치료를 할 수 있는 정밀의학의 실현을 앞당길 것입니다.

마크로젠은 다양한 장비를 통하여 매년 대량의 유전체 데이터를 생산해내고 있으며, 경제적인 비용으로 더욱 빠르고 정확한 유전체 분석 서비스를 제공하여 연구자의 연구를 도와 드리며, 일반인을 대상으로 한 진단 서비스도 제공하고 있습니다. 또한 Whole Genome, Exome, Transcriptome, Epigenome, 그리고 Metagenome 등 다양한 연구목적에 맞는 유전체 분석 서비스와 해당 데이터를 기반으로 한 Bioinformatics 결과를 제공하고 있습니다. 마크로젠은 오랜 기간 축적된 경험과 노하우를 바탕으로 전 세계 연구자들에게 Total Genomic Solution을 제시함으로써 NGS 기술을 활용한 정밀의학 분야를 선도하고 있습니다.

Workflow

• DNA/RNA Extraction
• Library Construction
• Sequencing
• Bioinformatical Analysis

ApplicationsTechnologiesBioinformatics

- Whole Genome Sequencing   (De novo / ReSeq) - Exome Sequencing - Targeted Sequencing - Transcriptome Sequencing   (mRNA / small RNA) - Epigenome Sequencing - Metagenome Sequencing

- HiSeq X Ten - NovaSeq 6000 - HiSeq 2500 / HiSeq 4000 - NextSeq 500 / MiSeq - PacBio RSII, PacBio Sequel - Ion PGM - Ion Proton - 10x Chromium - Bionano Saphyr

- De novo Assembly - Reference Mapping - Variant Calling (SNP / InDel) - CNV & SV - Gene Expression - Functional Annotations

 

[마크로젠] Next Generation Sequencing 서비스

https://youtu.be/S9OmRuHHAf4

 

Whole Genome Sequencing

WGS(Whole Genome Sequencing)은 유전체 전체를 한 번에 읽어내어 관련 유전정보를 분석하는 방법입니다.

X-Genome

Illumina사의 HiSeq X Ten Sequencing 장비를 사용하여 유전체 데이터를 생산해내는 마크로젠의 WGS(Whole Genome Sequencing) 서비스입니다.

마크로젠은 2014년 세계 최초로 HiSeq X Ten 장비를 도입한 후, 국내에서 유일하게 X-Genome 서비스를 제공하고 있으며, 연간 7만 명의 유전체를 분석할 수 있는 기술력과 장비를 갖추고 있습니다.

Features

• - CLIA 인증의 X-Genome 서비스
• - 집단 별 맞춤 치료, 희귀질환, 약물 유전체학 등에 사용됩니다.
• - Reference 기반의 기본 분석과 맞춤형 분석을 제공하고 있습니다.

Application Fields

• - 암 유전체 (Cancer Genomics)
• - 집단 유전체학 (Population Sequencing)
• - 약물 유전체학 (Pharmacogenomics Applications)

Sequencing Platform

• - HiSeq X Ten
• - HiSeq 4000
• - NovaSeq 6000

 

Whole Genome De novo Sequencing

De novo Sequencing은 reference 정보가 없는 새로운 생물종의 유전체정보를 새로이 밝히는 방법으로, 지금까지 밝혀지지 않은 미생물이나 동식물의 전체 유전체 정보를 알아내는 방법입니다.

Sequencing Platforms

• - HiSeq 2500 / HiSeq 4000 / HiSeq X Ten / NovaSeq 6000
• - NextSeq 500 / MiSeq
• - PacBio RSII / Sequel

Whole Genome Resequencing

Resequencing은 이미 알려진 Reference Genome을 활용하여 SNP(Single Nucleotide Polymorphism), InDel(Insertion & Deletion), CNV(Copy Number Variation), 그리고 Structural Variation 분석 등의 변이 분석이 가능한 방법입니다. Resequencing을 통해 얻어진 변이 정보는 질병과 관련한 유전자 발굴 및 맞춤의학 연구에 활용되고 있습니다.

Sequencing Platforms

• - HiSeq 2500 / HiSeq 4000 / HiSeq X Ten / NovaSeq 6000
• - NextSeq 500

 

[마크로젠] X-Genome 서비스

https://youtu.be/FhNK6LcYdn0

 

Exome Sequencing

Exome Sequencing은 유전자가 존재한다고 알려져 있는 Exon 영역만을 선택적으로 분석하는 방법입니다. 기존의 연구를 통해 얻은 유전자들만을 선택적으로 분석함으로써 Whole Genome Resequencing 보다 효율적, 경제적으로 연구할 수 있는 방법입니다.

Main Capture kit

• - Agilent SureSelect Exome Capture kit
• - Truseq Exome Enrichment Kit
• - 전체 exome 부분에 대한 Capture가 가능하며
  SNP 및 InDel 등의 변이 분석을 함께 제공해 드리고 있습니다.

Sequencing Platforms

• - HiSeq 2500 / HiSeq 4000 / HiSeq X Ten / NovaSeq 6000
• - NextSeq 500

 

 

Targeted Sequencing

Targeted Sequencing은 연구자가 관심있어 하는 특정 영역만 선택적으로 골라 분석하는 방법입니다.

Customized Targeted Sequencing

원하는 영역만을 Capture할 수 있도록 Customized kit을 제작을 통해 원하는 영역만을 선택적으로 분석하는 방법입니다.

• - Agilent SureSelect Human XT Custom
• - Illumina TruSeq Custom Amplicon

 

Transcriptome Sequencing

RNA를 대상으로 하는 Transcriptome Sequencing은 가장 많이 이용되는 연구 방법 중 하나입니다. Reference Genome에 대한 정보가 없는 생물을 연구하는 경우에는 De novo Assembly를 하여 해당 생물에 대한 Transcriptome에 대한 분석이 가능합니다.

Transcriptome 분석을 통해 샘플 간의 유전자 발현 값의 차이(Expression Profiling)를 확인 할 수 있습니다.

mRNA Sequencing

유전자를 지칭하는 염기서열의 숫자를 누적해 발현량을 표현하기 때문에 더욱 정확하며, 추가적으로 Novel Transcriptome, Fusion Gene, Alternative Splicing Variant에 대한 정보도 확인할 수 있어 다양한 연구에 활용할 수 있습니다.

Library Construction Kit

• < Illumina >
• - TruSeq RNA
• - TruSeq stranded mRNA
• - TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Human/Mouse/Rat
• - TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Gold Human/Mouse/Rat
• - TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin Human/Mouse/Rat
• - TruSeq Stranded Total RNA Sample Preparation Kits with Ribo-Zero Plant
• - TruSeq RNA (Microbe)
• - TruSeq stranded mRNA (Microbe)
• - ScriptSeq™ v2 RNA-Seq Library Preparation Kit (Epicentre)
• - TruSeq RNA Access
• - TruSeq Total RNA with Ribo-Zero
• - TruSeq mRNA (Insert size)
• - TruSeq Total RNA with Ribo-Zero (Insert size)

• < Others >
• - SMARTer Universal Low RNA library
• - SMARTer Ultra Low Input RNA library
• - SMARTer Stranded RNA library

Sequencing Platforms

• - HiSeq 2500 / HiSeq 4000 / HiSeq X Ten / NovaSeq 6000
• - NextSeq 500

Small RNA Sequencing

miRNA와 siRNA 등을 포함하는 small RNA는 포유동물에서 진화적으로 잘 보존되어 있는 RNA 기반의 유전자발현 조절기전 핵심인자이며, 발생과정에서 유전자발현을 조절하는 데 관여한다고 알려져 있습니다. 특히나, 21~23개 염기로 이루어진 비 암호화 small RNA들이 siRNA나 miRNA로 작용하는 기전에 대한 연구가 활발히 진행되고 있습니다.

Library Construction Kit

• < Illumina >
• - Small RNA library

• < Others >
• - SMARTer smRNA library
• - NEBNext Small RNA library

Sequencing Platforms

• - HiSeq 2500 / HiSeq 4000
• - NextSeq 500

 

Metagenome Sequencing

Metagenome Sequencing은 다양한 환경에 존재하는 미생물군집(Microbial Community)을 확인하는 방법으로 주로 Bacteria, Fungi의 분포 및 종류를 분석할 수 있습니다. 즉 특정 환경에서 채집된 샘플이 어떠한 미생물군집으로 이루어져 있는지 알 수 있으며 이들의 상호작용과 역할들을 확인할 수 있습니다.
또한 Fusion Primer를 제작하여 여러 샘플을 섞어 실험이 진행되며, 이에 따라 Bacteria뿐만 아니라 Archaea에 대한 분석도 한번에 진행 가능합니다. 특히 인간의 장내 미생물의 유전자 수는 인간 유전자의 약 150배에 이르는데 최근 장내 미생물들의 게놈(Genome)인 마이크로바이옴(Microbiome)에 대한 중요성까지 부각되면서 Metagenome은 제2의 게놈(Second Genome)이라 불리고 있습니다.

Sequencing Types & Platforms

• - 16S rRNA Region : MiSeq system
  • - V3 to V4 regions
  • - Customized regions
• - Full-length 16s rRNA : PacBio RSII system
• - Shotgun Metagenome : MiSeq / HiSeq4000
• - 18S rRNA / ITS region : MiSeq system

 

 

Epigenome Sequencing

Epigenome Sequencing은 외부환경요인에 의하여 특정 유전자의 기능이 제대로 발현되었는가를 확인하는 방법입니다.

유전자의 전사에(Transcription) 대한 후성유전학적인 조절기전은 DNA의 메틸화(methylation) 및 히스톤 단백질(histone protein)의 아세틸화(acetylation)가 가장 대표적이며 NGS기술을 이용하여 더 효과적으로 분석할 수 있습니다.

Whole Genome Bisulfite Sequencing

WGBS 은 메틸화되지 않은 시토신(Cyotsine)을 우라실(Uracil)로 변환시키는 물질인 아황산수소나트륨(Sodium Bisulfite)의 성질을 이용해 DNA를 처리한 후 염기서열을 분석하여 DNA의 메틸화 정도를 관찰하는 방법입니다.

Sequencing Platforms

• - HiSeq 2500 / HiSeq 4000 / HiSeq X Ten / NovaSeq 6000

MBD (Methyl-CpG Binding Domain) Sequencing

DNA가 메틸화되면 특이적으로 CpG 서열에만 단백질(Methyl-Binding Domain, MBD)이 결합하게 됩니다. 이들 단백질에 붙어 있는 DNA 염기서열만을 선택적으로 분석하여 유전체가 얼마나 Methylation 되어 있는지 분석하는 방법이 MBD Sequencing입니다.

Comparison of Epigenomic Application

ApplicationBisulfite ConversionAdvantages

WGBS	Yes	High resolution
MBD Sequencing	No	Methylated CpG enrichment Methylated region enrichment High resolution

Sequencing Platforms

• - HiSeq 2500 / HiSeq 4000 / NovaSeq 6000

 

 

 

CES

CES 사업부

CES(Capillary Electrophoresis Sequencing) 서비스는 생화학적 방법을 이용하여 DNA염기서열을 분석하는 서비스입니다. 마크로젠의 CES서비스는 가장 보편화된 서비스인 Standard Sequencing 뿐만 아니라 생물체의 종감별 및 식별서비스인 Identification서비스, Fragment 분석서비스, 그리고 기존 Sequencing 방식에서 새롭게 응용된 Customized Sequencing서비스까지 다양한 서비스 라인업을 통하여 고객만족을 극대화하고 있습니다. 또한 분자생물학 기초연구, 육종연구, 유전질환연구, 친자확인, 법의학연구 등 폭넓은 분야에서 다양한 연구목적으로 활용됨으로써 생명공학산업 발전에 주요한 밑거름이 되고 있습니다.

마크로젠의 CES서비스는 일반 Sequencing 서비스뿐만 아니라 다양한 고객요청에 따른 추가적인 맞춤서비스(gDNA추출, Primer 합성, PCR 증폭 및 정제)를 제공하고 있습니다. 뿐만 아니라 고객편의를 위하여 별도의 온라인 주문 시스템을 통해 원하는 서비스를 의뢰하실 수 있으며 각 주문샘플에 대한 전 프로세스 모니터링과 함께 최종결과에 대한 사후관리를 진행해드립니다.

Workflow

• gDNA Extraction
• PCR Amplification
• Purification
• Sequencing
• Analysis Data

 

Standard Sequencing

Standard Sequencing은 고객이 의뢰한 PCR product와 Plasmid DNA 등을 Sequencing하는 서비스로서 CES(Capillary Electrophoresis Sequencing) 자동화 시스템과 함께 다년간의 풍부한 경험을 바탕으로 더욱 빠르고 정확한 서비스를 제공하고 있습니다.

결과발송 후에는 Sequencing 분야의 전문관리자들이 사후관리까지 함께 도와드립니다.

Features

• - ABI 3730xl System
• - High quality results 및 Normal read length (1,050bp)
• - LIMS (Laboratory Information Management System)를 기반으로 주문접수부터 결과발송까지 실시간 모니터링 가능
• - 샘플접수 후 24시간 내 결과제공(오후 6시이전 접수에 한함)
• - 기본적인 분석서비스 무료제공(BlastN 또는 BlastX를 통한 단백질과 DNA염기서열 수주에서 상동성 검색)
• - Universal primer 무료제공

Standard Sequencing Single/Plate

Standard Sequencing은 Single tube와 96well plate 두 가지로 실험 진행이 가능합니다.

Single Tube Sequencing

• - 샘플을 Individual tube에 준비하여 의뢰하는 서비스
• - 무료 재반응 서비스 제공

96well Plate Sequencing

• - 샘플을 96well plate에 준비하여 의뢰하는 서비스
• - 1 plate에 최대 6가지의 Primer 사용 가능
• - 경쟁력있는 가격

Additional Service

• - PCR product 정제 (Single/Plate 모두가능)
• - Gel extraction
• - Clones 채취 &Plasmid 추출 (Single/Plate/Agar plate 모두가능)
• - BAC/Fosmid/Cosmid 추출
• - Gel running을 통한 농도확인

Difficult Template Sequencing

Standard Sequencing 결과확인 후 또는 고객의 정보를 바탕으로 특이 구조를 보유한 Template를 Sequencing하는 서비스 입니다.

* 특히 아래와 같은 특이구조를 가진 Template에 적합합니다.

• - Hairpin 구조의 siRNA
• - 특이한 2차 구조
• - G-rich
• - Homopolymeric tracts(PolyG)
• - GT-Repetitive regions

아래의 예시에서 보시는 것과 같이 고품질의 개선된 결과를 안정적으로 얻을 수 있습니다.

 

 

 

Identification 서비스

16S/18S/26S rRNA&ITS Region Full Sequencing

Bacteria 및 Fungi(사상균, 효모)의 ribosomal RNA 유전자를 증폭시켜 염기서열을 분석하고 rRNA Database(NCBI)를 이용하여 대상 미생물의 상동성을 확인하는 서비스입니다.

프로세스 공정은 Bacteria, Fungi(사상균, 효모)의 gDNA 추출부터 PCR 증폭, 정제, sequencing, BI 리포트까지 전 과정을 직접 관리•수행합니다.

Bacteria+

Bacteria의 경우 16S rRNA gene을 27F, 1492R primer를 이용하여 PCR을 진행한 뒤 Inter-primer인 785F, 907R primer로 Sequencing하여 균을 동정하는 서비스 입니다. 고객이 원하는 경우 Primer를 추가로 선택/변경하여 약 1,350bp 이상의 염기서열을 제공해 드립니다.

Fungi

18S rRNA region의 염기서열 분석을 통해 1,600bp이상, ITS region의 염기서열 분석을 통해 500bp 이상, 그리고 26S rRNA gene(D1/D2/D3 region)의 염기서열 분석을 통해 1,300bp 이상의 결과를 보장합니다.

Animal/Plant Identification

생물체의 유전자 중에서 종(Species) 판별에 사용되는 특정 유전자 Region인 'DNABarcode' 부위를 Sequencing하여 해당 생물의 종을 판별하는 서비스 입니다.

샘플을 보내주시면 gDNA추출부터 각 Barcode 부위의 Sequencing 결과, 그리고 분석 리포트까지 진행해 드립니다.

Features

• - 식물의 잎, 동물의 조직, 깃털, 곤충다리 등 생물체의 작은 부분으로도 종을 구별할 수 있습니다.
• - 형태적으로 구별이 어려운 생물이나 생물의 발달단계에 관계없이 Barcode는 항상 동일한 정보로 판별이 가능합니다.
• - 표준화된 Barcode 기법을 사용하여 기존의 생물종 데이터와 비교하여 판별할 수 있으며 신종 예측 및 미등록종의 동정도 가능합니다.
• - 생물자원 종판별, 생물자원 검증, 원재료 검증, 생물오염 검증 등에 활용될 수 있습니다.
• - 특정 표준유전자 또는 특이샘플에 대한 고객맞춤서비스도 가능합니다.

구분샘플종류분석 유전자추가 분석

Animal Barcoding	동물, 곤충, 조류, 물고기 등	COI	12S/16S rRNA, ITS
Plant Barcoding	식물	matK, rbcL	rpoB, rpoC1, atpF-atpH, psbK-psbI. psbA-trnH

Rapid-ID

MALDI-TOF 단백질 분석 기술을 이용한 미생물질량분석동정 서비스로 세계 최초 FDA Clearance 획득 및 AOAC 인증된 시스템을 사용합니다.
기존 염기서열 동정서비스에 비해 소요시간이 짧으며 정확한 미생물 동정을 원하는 고객에게 적합한 서비스입니다.

Features

• - 익일 오전 10시 Report 발송가능 (당일 오후 1시 전까지 접수 건에 한해)
• - 선택적 Service Type (TAT 0, 1, 3) 및 Type별 금액 상이
• - 고유의 Adaptive Binning 기술로 Align Peaks
• - 최초 FDA Clearance 미생물동정 정확도 획득 및 미국 인증기관인 AOAC Validation 인증

 

 

Fragment 분석서비스

Fragment 분석서비스는 Genotyping, DNA profiling과 의학적 Mutation detection, Agricultural research 등 매우 다양한 서비스를 포함 하고 있습니다.

마크로젠은 다양한 경험과 노하우를 바탕으로 Microsatellite 분석(VNTRs)서비스를 제공합니다.

Fragment 분석서비스 (Genescan서비스)

Fluorescent label로 표지 된 Primer를 이용하여 증폭된 PCR product를 Fragment에 따라 분리 및 분석하는 서비스입니다.

Service types

• - Microsatellite instability
• - Amplified fragment length polymorphism (AFLP) 분석
• - Terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) 분석
• - Relative fluorescent quantization - Loss of heterozygosity (LOH), Aneuploidy assays, and Large chromosomal deletion detection
• - Sequence-related amplified polymorphism (SRAP)

Features

• - 결과 데이터는 FSA 파일로 제공(PDF, Excel 파일 가능)
• - 샘플 도착 후 영업일 기준 3~7일 내 결과제공
• - PCR Optimization에서부터 Fragment 분석까지 고객 맞춤서비스 가능

Standard Marker Types

Dye SetDS-30DS-33-

Blue	6-FAM	6-FAM	Sample Labeling Dyes
Green	HEX	VIC
Yellow	NED	NED
Red	-	PET
Internal Standard Size Marker (Maximum detection size)	350 ROX (350bp)	120 LIZ (120bp)
	400HD(400bp)	500 LIZ(500bp)
	-	600 LIZ(600bp)
	-	1,200 LIZ(1,200bp)

 

 

Customized Sequencing

PCR Optimization/Amplification 서비스

PCR Optimization 서비스는 고객이 원하는 Target region과 관련하여 Reference와 함께 Cell/gDNA를 제공해 주시면 Primer디자인부터 PCR 증폭, Sequencing, 그리고 BI 리포트까지 전 프로세스 공정을 수행•분석해드리는 고객 맞춤형서비스 입니다.

또한 PCR 증폭, Touch down PCR 증폭, Nested PCR 증폭, FFPE PCR 증폭실험 등 샘플 특이성으로 인한 재실험률이 높은 경우 고객맞춤형 PCR 증폭서비스를 통해 문제점을 해결해드립니다.

Features

• - 고객 맞춤형 서비스
• - 고품질의 결과제공을 위한 pre-test 진행
• - 전문적인 연구인력을 통한 정확하고 신속한 결과발송 및 관리
• - 동물/식물/곤충 등 샘플에서 gDNA추출가능

Pyrosequencing

Pyrosequencing은 Nucleotide가 DNA와 중합이 일어날 때, 생성되는 Pyrophosphate(PPi)를 이용하여 염기서열을 확인하는 Sequencing 서비스입니다. DNA 서열과 상관없이 특정 Gene의 Expression 레벨을 조절하는 것에 대한 후성유전체학(Epigenetics)의 연구가 활발해지면서 DNA methylation분석 서비스에 대한 관심이 높아지고 있습니다. 이러한 DNA Methylation 분석은 Pyrosequencing 서비스를 통해 매우 정확하고 신뢰도 있는 결과를 기대할 수 있습니다.

Features

• - Methylation studies
• - SNP & InDel 분석
• - Cancer 연구에 활용
  • · 5% 이하의 low allele frequency도 발견가능
  • · Somatic mutation 분석에 적합
  • · Di-, tri-, tetra allelic mutation 분석 가능
• - NGS결과에 대한 Validation 가능
  • · Biomarker verification
  • · Validation & verification of GWAS & NGS data

NGS Validation 서비스

NGS(Next Generation Sequencing) 서비스 이용 후 해당 데이터의 정확도와 신뢰도를 높이기 위하여 Sanger Sequencing 방법을 이용하여 이를 검증하는 서비스 입니다. Chromosome position 또는 Reference sequence를 알려주시면 특정 부위의 SNP와 Mutation 결과를 분석합니다.

Features

• - 마크로젠의 NGS 서비스를 이용한 고객의 경우 해당샘플을 바로 전달 받아 더욱 빠르고 정확한 실험이 가능
• - Chromosome position과 Reference sequence가 확인되면 전체 Primer 디자인부터 Sequencing 결과확인, Variant 비교분석까지
  One-stop 서비스진행으로 편리한 이용이 가능
• - 보다 정확한 결과전달을 위하여 필요 시 Normal control의 비교데이터 확인이 가능하며 동일부위에 대하여 두 가지 Primer set를 이용한 데이터 확인도 가능

MLST 분석서비스

MLST(Multilocus Sequence Typing) 분석은 Bacteria, Fungi 등 동일 종 내의 균주들을 분류하기 위한 분석방법으로 균종의 특이적인 5~7개 Housekeeping gene들을 Sequencing하여 각각의Sequence Type(ST)의 연관관계를 분석하고, 동일균종 내의 각 균주별 다양한 대립유전자의 조합을 통해 유전적/분자적 진화관계를 확인할 수 있습니다.

One-click Sanger Sequencing

일반적으로 많이 연구되고 있는 특정유전자 변이를 분석하는 방법으로 One-click만으로 편리하고 빠르게 이용하실 수 있습니다. 또한 gDNA추출부터 PCR 증폭, Sequencing 및 SNP분석까지 최적화된 결과를 받아볼 수 있습니다.

마크로젠의 전문연구진과 오랜 노하우를 바탕으로 제작된 맞춤형 Primer set를 통해 특정 Exon 부위를 Sequencing 하여 Variant 분석결과를 제공해 드립니다.

Primer Walking 서비스

Single primer extension으로 한번에 읽어낼 수 없는 Plasmid나 PCR product의 염기서열을 분석하는 서비스이며 보통 2~10kb 정도의 시퀀스 정보를 얻고자 할 때 이용하는 방법입니다. 고객이 직접 제공하거나 지정한 Primer로 End sequenceing을 수행한 후 얻은 결과물로부터 Internal primer를 디자인하여 제작합니다. 이는 새로운 Primer로 같은 Template를 반응하여 얻은 결과로부터 또 다시 적정한 위치에서 Internal primer를 디자인하여 계속 연장하며 1회 Walking 수행에 4일정도 소요, 한 방향 당 약 500~800bp 연장이 가능합니다.

Cloning 서비스

유전체에서 특정유전자 또는 특정 DNA절편을 분리한 후 원하는 Cell을 이용하여 대량으로 복제시키는 방법으로 PCR Product를 마크로젠에서 제공하는 Vector(T-vector or Blunt-vector)에 삽입하거나 고객의 Vector(Sub-cloning)를 통해 해당 서비스를 제공합니다. PCR product의 경우 여러 가지 원인에 의해 한 종류 이상의 PCR product가 존재할 수 있는데 이러한 경우 정상적인 Sequencing 결과를 얻을 수 없지만 Cloning을 통해 이를 개선할 수 있습니다.